

Подготовку научных кадров через аспирантуру (Лицензия на право осуществления образовательной деятельности
через аспирантуру № 6017 от 09.02.2006 по 09.02.2011) Институт проводит по 6 специальностям:
Науки о Земле:
- 25.00.27 – Гидрология суши, водные ресурсы, гидрохимия
- 25.00.35 – Геоинформатика
- 25.00.36 – Геоэкология
Биологические науки:
- 03.00.15 – Ботаника
- 03.00.16 – Экология
- 03.00.18 – Гидробиология
Прием и выпуск из аспирантуры осуществляются в соответствии с утвержденными в Управлении кадров РАН планами.
Подготовка аспирантов проводится по индивидуальным планам, рассмотренным на заседаниях научных лабораторий и утвержденным директором Института.
Аспиранты ежегодно аттестуются в своих научных подразделениях.
Аспиранты активно включены в выполнение ежегодных планов НИР и являются соисполнителями разделов соответствующих разрабатываемым проблемам, участвуют с докладами на Российских и международных конференциях.
Институт через основную аспирантуру и частично через основную заочную аспирантуру готовит кадры для себя.
В форме основной заочной аспирантуры Институт готовит кадры для сторонних организаций РАН и МВО РФ.
Темы диссертационных работ формулируются в соответствии с перспективными направлениями развития научных исследований.
В качестве дополнительных возможностей в освоении новых, современных методов лимнологических исследований Институт использует приглашения зарубежных
коллег на стажировку аспирантов по определенным проблемам.
C 2003г. в Институте открыта докторантура по трем специальностям:
- 25.00.27 – Гидрология суши, водные ресурсы, гидрохимия
- 25.00.36 – Геоэкология
- 03.00.16 – Экология
Подготовка кадров через докторантуру проводится, в основном, в форме заочного обучения иногородних соискателей.

|